一盘神秘的录像带，记录了千年神器中千年眼的掌控者——贝卡斯·J·克罗佛多的黑暗决斗，他向武藤游戏发出挑战，但时间的枷锁让武藤游戏陷入困境，败下阵来，这一战后，武藤双六的灵魂被贝卡斯的千年眼力量禁锢在灵魂封印卡中，在漫画版中，这卷录像带是由贝卡斯寄给游戏的。
为了拯救灵魂被囚的爷爷，武藤游戏与他的伙伴们踏上征程，直面贝卡斯进行决斗，他们并肩作战，与信任的伙伴们一同，还有内心的另一个自我，在决斗者王国的一战结束后，武藤游戏的声名迅速传遍，神秘的埃及石板在日本展出，揭开了千年神器的秘密、三千年前的战斗、三张神之卡的踪迹，以及隐藏在千年积木中的无名法老王的遗忆。
海马濑人在一次机缘巧合下，获得了神之卡之一的欧贝利斯克的巨神兵，他为了集齐其余两张神之卡，在童实野市举办了决斗城市大赛，这场大赛以赌牌为规则，同时展示了新一代的决斗盘技术，武藤游戏，为了寻找心中那个无名法老王的记忆碎片，也加入了这场激烈的大赛。
各路决斗高手为了争夺六张拼图卡，争夺最后的参赛资格，展开了激烈的较量，而古鲁斯集团派出的稀有卡猎人也在其中暗流涌动，企图干扰比赛的进程。
整个故事交织着友情、信任、挑战与成长，展现了主角们为了追求真相和正义，不断突破自我，与命运抗争的决心和勇气。
0