在赛尔号精灵战争卡牌中，双方各自准备一副由25张精灵卡组成的完整牌组，分别放置于对战盘的【休息舱】内,作为各自的牌库。
游戏开始时，双方各自从牌库中各摸出5张精灵卡，并以背面形式放置在宇宙战场的5个位置上,作为主战精灵的阵容。
随后，双方各自从牌库顶部再摸出5张精灵卡,作为初始手牌。
出击顺序由猜拳决定，猜拳失败的一方将作为防守方，防守方方的精灵将先进行进攻，攻击方在进攻之前需要从牌库中抽取一张精灵卡,补充自己的手牌。
攻击方首先翻开自己的一张精灵卡,然后指定防守方的一张精灵卡进行攻击。
在支援阶段，双方各自从手牌中打出一张精灵卡进行支援，双方选择完成后,同时翻开支援精灵卡进行对抗。
胜负判定规则如下：比较双方的战斗力，战斗力较弱的一方，其主战精灵和支援精灵都会被吸入【黑洞】中，战斗力较强的一方，其支援精灵则依然可以继续战斗，而主战精灵则因体力耗尽需要进入【休息舱】进行养伤。
当一方的战场精灵全部被消灭时,另一方将宣布胜利。
整个游戏过程持续进行,直到一方战场上的精灵全部被消灭为止。
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